目前南方黃雞傳喉疫苗免疫后副反應相對較重，個別雞群甚至出現(xiàn)免疫后直接發(fā)病。副反應及發(fā)病率與雞群飼養(yǎng)管理狀況、環(huán)境變化和其它疾病感染有很大相關(guān)性。尤其是結(jié)膜炎癥狀較為明顯，免疫雞群出現(xiàn)流眼淚、結(jié)膜潮紅、瞎眼等癥狀，發(fā)病比例可達到30%左右，大群同時伴有呼吸道癥狀，表現(xiàn)為呼嚕、咳嗽、喘，伸頸呼吸，部分嚴重雞只可咳出血痰。
發(fā)病原因：
1、與疫苗毒力有關(guān)，傳喉疫苗毒力相對較強，副反應相對較大；
2、疫苗使用有關(guān)：部分養(yǎng)殖戶仍存在隨意加大免疫劑量，漏免，疫苗瓶隨亂扔放，免疫方式或操作不當，導致副反應過大，散毒和疫苗毒力返強，造成低保護雞只感染；
3、與免疫抑制和其它疾病感染或潛在感染有關(guān)：霉菌毒素、新城疫、溫和型流感、法氏囊、球蟲等免疫抑制因素和疾病存在，會放大疫苗副反應程度；
4、與飼養(yǎng)管理及環(huán)境因素有關(guān)：環(huán)境條件惡劣或飼養(yǎng)管理較差的雞群導致的反應程度嚴重；
5、消毒不徹底或不注重消毒，保溫控制不好，溫度忽高忽低，通風不良，會加重傳喉疫苗副反應；
6、免疫間隔不夠或疫苗免疫過于集中，導致傳喉副反應加大。部分養(yǎng)殖戶在做完新支二聯(lián)疫苗后，雞群出現(xiàn)輕微呼吸道，未能有效控制，如直接做傳喉疫苗，反而使疫苗副反應程度更大；
7、南方黃雞由于多采用放養(yǎng)形式，老鼠、昆蟲傳播病原體不能有效控制，再加上種雞群一些疾病凈化不徹底，導致沙門氏菌和支原體感染相對普遍，尤其支原體存在，導致粘膜系統(tǒng)受損，影響免疫應答和加重免疫反應程度；
8、南方養(yǎng)殖數(shù)量較多，密度相對較大，不同日齡雞群混養(yǎng)相對普遍，疫苗毒尤其是傳喉疫苗毒二次感染現(xiàn)象非常普遍；
9、生物安全程度重視不夠，雞糞隨便堆放，雞販子經(jīng)常串門收雞等也會加重疾病傳播程度，疾病多重感染自然會加重疫苗反應。